MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p3

Total Repeats: 1999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016595	CGT	2	6	6815	6820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016595	TCC	2	6	13129	13134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016595	TGC	2	6	13140	13145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016595	CGC	2	6	13224	13229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016595	TC	3	6	13234	13239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016595	GACG	2	8	14550	14557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016595	ACC	2	6	18210	18215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016595	AG	3	6	19461	19466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016595	CGCCA	2	10	20224	20233	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_016595	GCC	2	6	20244	20249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016595	TCC	2	6	21192	21197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_016595	CCA	2	6	21217	21222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_016595	GCC	2	6	21254	21259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016595	AAC	2	6	24360	24365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016595	CAA	2	6	24616	24621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016595	AT	3	6	24781	24786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016595	AT	3	6	24906	24911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016595	AT	3	6	24917	24922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016595	TGA	2	6	24974	24979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016595	GCATT	2	10	24981	24990	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016595	TCA	2	6	24996	25001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016595	CCG	2	6	25032	25037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_016595	CAT	2	6	25132	25137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016595	ATT	2	6	25173	25178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016595	AGA	2	6	25196	25201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016595	GCGG	2	8	25351	25358	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016595	GGC	2	6	25368	25373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016595	CGG	2	6	25454	25459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016595	CAG	2	6	30547	30552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016595	CCG	2	6	30564	30569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016595	GAG	2	6	35608	35613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016595	GGCGG	2	10	35626	35635	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016595	CGGC	2	8	35636	35643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016595	TCC	2	6	37187	37192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016595	GC	3	6	37199	37204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016595	CTT	2	6	37205	37210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016595	TGA	2	6	38081	38086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016595	GT	3	6	38121	38126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016595	GAT	2	6	38139	38144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016595	CAA	2	6	38166	38171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016595	TCT	2	6	38173	38178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016595	ATA	2	6	38201	38206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016595	GGC	2	6	38260	38265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016595	CGT	2	6	38337	38342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016595	AGG	2	6	38379	38384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016595	CGC	2	6	38434	38439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_016595	CG	3	6	38441	38446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016595	GTG	2	6	38817	38822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016595	TCG	2	6	38823	38828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016595	CGT	2	6	38989	38994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016595	GGC	2	6	39000	39005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016595	GCGG	2	8	39033	39040	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016595	TTCT	2	8	40068	40075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016595	T	6	6	40904	40909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016595	CGC	2	6	43658	43663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_016595	CTC	2	6	45376	45381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_016595	CGGA	2	8	47442	47449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016595	CGC	2	6	48660	48665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_016595	CGA	2	6	50757	50762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016595	GAG	2	6	50771	50776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016595	TGC	2	6	50844	50849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016595	CCGT	2	8	50870	50877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016595	TGT	2	6	50892	50897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016595	GC	3	6	50965	50970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016595	TGA	2	6	50979	50984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016595	GGCGC	2	10	50988	50997	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016595	CGC	2	6	51015	51020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_016595	TCCG	2	8	51066	51073	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016595	CGAG	2	8	51150	51157	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016595	CGA	2	6	51228	51233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016595	GGT	2	6	51265	51270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016595	GGGCT	2	10	51322	51331	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016595	CGGC	2	8	51341	51348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016595	GCT	2	6	51349	51354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016595	GTC	2	6	51385	51390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016595	GTGG	2	8	51391	51398	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016595	TCC	2	6	51440	51445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_016595	CGG	2	6	51513	51518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016595	CGG	2	6	51528	51533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016595	GCC	2	6	51576	51581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_016595	GCGCC	2	10	51582	51591	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_016595	GTC	2	6	51598	51603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016595	CG	3	6	51609	51614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016595	CCG	2	6	51633	51638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_016595	GCC	2	6	51676	51681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_016595	TGC	2	6	51711	51716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016595	GTT	2	6	51745	51750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016595	CCG	2	6	51768	51773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016595	CGA	2	6	51777	51782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016595	GTC	2	6	51794	51799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016595	GCTG	2	8	51816	51823	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016595	AGC	2	6	53080	53085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016595	CGAT	2	8	53091	53098	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016595	GCCG	3	12	55151	55162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016595	G	6	6	55606	55611	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016595	AG	3	6	55618	55623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016595	CAA	2	6	55650	55655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016595	TGAC	2	8	55687	55694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016595	GTCA	2	8	55696	55703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016595	GCG	2	6	57258	57263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016595	CCG	2	6	57330	57335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_016595	CAT	2	6	57394	57399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016595	CTC	2	6	57464	57469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_016595	CCG	2	6	57471	57476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_016595	GTTC	2	8	57498	57505	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016595	TCC	2	6	57506	57511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_016595	TGG	2	6	57530	57535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016595	GATG	2	8	57607	57614	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016595	CGA	2	6	57637	57642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016595	ATGG	2	8	57667	57674	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016595	CGC	2	6	57739	57744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_016595	CCA	2	6	57751	57756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_016595	GTCT	2	8	58854	58861	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016595	CGG	2	6	58894	58899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016595	GCC	2	6	58914	58919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_016595	C	6	6	60700	60705	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
117	NC_016595	TTCT	2	8	60706	60713	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016595	GGCC	2	8	60736	60743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016595	AGCC	2	8	60746	60753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016595	CG	3	6	61681	61686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016595	CCT	2	6	61691	61696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_016595	CCG	2	6	61763	61768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_016595	TCC	2	6	63083	63088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_016595	TCGT	2	8	63126	63133	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016595	CTT	2	6	63185	63190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016595	CGG	2	6	63238	63243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016595	TTG	2	6	64041	64046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016595	GCC	2	6	64060	64065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_016595	CCT	2	6	64959	64964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_016595	ACG	2	6	64998	65003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016595	AAG	2	6	65055	65060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016595	T	6	6	65078	65083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016595	GCG	2	6	65134	65139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016595	TGA	2	6	65142	65147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016595	GAA	2	6	65163	65168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016595	GGGGA	2	10	65929	65938	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016595	GGA	2	6	66009	66014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016595	CGGTT	2	10	66028	66037	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_016595	GCCA	2	8	66040	66047	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016595	GGC	2	6	66058	66063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016595	GTC	2	6	66091	66096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016595	TTG	2	6	66111	66116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016595	CCG	2	6	66138	66143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_016595	GC	3	6	66156	66161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016595	GCC	2	6	67273	67278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_016595	CT	3	6	68809	68814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016595	CGG	2	6	68827	68832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_016595	CTC	2	6	69645	69650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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150	NC_016595	GGT	2	6	69710	69715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016595	GCC	2	6	71778	71783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_016595	GGCGA	2	10	73117	73126	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
153	NC_016595	TCA	2	6	73181	73186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_016595	CGG	2	6	73222	73227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_016595	TCA	2	6	73247	73252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_016595	CGT	3	9	73264	73272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_016595	GCG	2	6	76313	76318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_016595	CGG	2	6	76482	76487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_016595	GGC	2	6	80333	80338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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183	NC_016595	GTC	2	6	87394	87399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_016595	CGGGCG	2	12	146751	146762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_016595	GCC	2	6	146912	146917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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399	NC_016595	GT	3	6	171895	171900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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